卧虎藏龙贰当中的箱子主要分为皇城青山堂任务宝箱、野外固定刷新宝箱、藏宝图挖掘宝箱三类，核心点位集中在皇城建筑群、门派场景、昆仑雪山、桃花谷以及镇远关野外区域，绝大多数高空宝箱需要依靠轻功完成抵达，秘境与山洞之内还分布着大量容易被忽略的藏宝箱。皇城青山堂的任务宝箱是全游戏最知名的点位，宝箱坐落于青山堂顶层下方的夹层平台，处在大殿圆形戏台的缝隙下方，正常步行无法抵达，需要开启轻功从顶层屋檐向下方跳跃落至二层回廊，沿着回廊边角寻找就能精准定位，该宝箱和秘籍、瓦片共同组成轻功奇遇的收集目标，完成收集可以解锁对应的武学奖励。
野外地图的宝藏箱子拥有固定刷新机制，镇远关整张野外地图遍布数十处刷新点位，宝箱每隔固定时长完成一轮刷新，部分点位不会每次都产出宝箱，打开宝箱能够获得炼器丹、武学残章、五魂养成材料以及对应等级的装备，昆仑区域的宝箱大多分布在山间水潭与崖壁洞窟当中，昆仑山下方的小型水潭内部就暗藏一处宝箱，周边会刷新猿类野怪，清理完怪物之后即可开启宝箱。药王谷、唐家堡、巨剑门各个门派场景都设置了专属宝箱点位，药王谷宝箱藏匿于瀑布后方的屋顶之上，巨剑门宝箱诞生于水域洞窟之内，唐家堡宝箱驻守在堡内偏隐蔽的院落角落，桃花谷的神仙洞石碑周边同样刷新野外宝箱，山洞内部的宝箱还能够触发专属奇遇。
藏宝图产出的挖宝宝箱没有固定坐标，藏宝图可以通过日常任务、副本通关、帮会玩法、擂台竞技多种途径获取，拿到藏宝图之后完成鉴定操作，图纸会给出大致的寻宝范围，沿着地图指引前往指定区域开展挖掘，挖掘过程有概率遭遇野怪阻拦或是触发随机奇遇，成功挖开宝箱可以拿到高阶打造材料与稀有坐骑道具。收集宝箱的游玩路线可以按照主城到野外再到门派的顺序推进，皇城优先完成青山堂宝箱收集，之后前往镇远关扫荡野外刷新宝箱，再依次前往昆仑、桃花谷、各个门派地图搜寻山洞与高处的隐藏宝箱，探索的时候优先激活轻功的连续腾跃能力，高山、房顶、水下洞窟这类常规路线难以抵达的位置往往会刷新高品质宝箱。
宝箱产出的道具可以全方位支撑角色养成，紫色品质装备能够直接替换副本掉落的普通防具，武学残章可以用来补齐高阶功法，炼器丹是打造高阶神兵的必备消耗道具，大量宝箱还会开出产业相关的经营道具，大幅度提升挂机收益。批量开宝箱的过程中还可以同步完成游历探索成就，把全地图宝箱尽数收集能够解锁永久的属性加成，收集宝箱的过程也可以当作大世界跑图的核心目标，兼顾养成资源获取与地图探索体验。
