主将的选择直接影响队伍的整体表现和战术执行效果。优先考虑拥有主将技能的武将，这类武将担任主将时能触发额外效果，为队伍带来显著增益。例如曹操的乱世奸雄技能在主将位置可额外恢复兵力，刘备作为主将时虚弱概率大幅提升，司马懿主将能获得更高谋略伤害加成。这类武将的主将技能往往能改变战局走向，是组建核心队伍的首选。
统帅和智力属性是选择主将的重要依据。高统帅武将如曹操、程普能有效降低兵刃伤害，适合承受敌方火力；高智力武将如诸葛亮、周瑜则能抵御谋略攻击并提升输出效率。部分武将如赵云虽无主将技能，但凭借出色的四维属性仍能胜任主将职责。需注意兵种适性，S级适性武将的属性加成更高，例如盾兵S的曹操搭配藤甲兵可形成坚固防线。
输出型主将如关羽、吕布需配置高发动率战法增强爆发力；辅助型主将如刘备、荀彧适合携带治疗或减伤战法。锋矢阵、八门金锁等阵法对主将有额外加成，需根据队伍特性选择。部分战法如竭力佐谋、刮骨疗毒能针对性保护主将，避免被敌方集火击溃。
同阵营武将组合能激活额外属性加成，如魏盾阵容中曹操主将搭配满宠可形成攻防一体体系。同时需预判敌方可能使用的针对主将的战法，如当锋摧决可禁用指挥战法，对阵此类技能时需调整主将站位或配备净化类战法。侦查功能可提前获取敌方兵种信息，便于调整主将人选实现兵种克制。
配备周泰、郭淮等护盾型副将可有效分摊伤害，草船借箭、抚辑军民等战法能提供持续恢复。特殊情况下可考虑潜龙阵激活双主将效果，但需注意该阵法会降低主将输出。最终阵容需通过多轮实战测试，平衡输出、控制与续航能力，形成稳定战斗体系。
