要开启口袋妖怪火红的二周目内容，玩家必须首先完成一周目并收集超过60种宝可梦图鉴，随后大木博士会前来将图鉴升级为全国模式，从而触发新的剧情线。完成图鉴升级后，游戏会引导玩家前往七岛区域进行探索，这是二周目的关键环节，涉及后续任务和技能的获取。
开启二周目后，玩家需要从枯叶市的码头乘船前往一之岛，这是七岛之旅的起点。在一之岛上，前往岛屿北部的宝可梦中心左侧的火箭队游戏厅，击败内部的火箭队成员并解救被绑架的研究员，之后在岛屿南部的码头与船长对话，即可解锁前往其他岛屿的航线，为抵达灯火山做准备。
到达一之岛后，通过码头乘船前往二之岛或其他相关岛屿，这些岛屿通常需要通过冲浪术等秘传技能才能顺利到达，玩家需提前掌握必要的移动能力。灯火山的入口通常位于岛屿的特定区域，例如从火照山道向北冲浪即可找到入口，沿途可能遇到火箭队成员把守，需击败他们以推进剧情。
进入灯火山内部后，玩家需要沿着山洞路径向上前进，途中可能遇到岩石障碍，需使用特定技能如碎岩术来清除道路。在顶层区域，推开岩石后有机会遇见火焰鸟，并可尝试收服它，同时在山洞深处找到红宝石等重要道具，这些物品是解锁后续任务的关键。
玩家可以获取关键秘传机技能，例如在灯火温泉与特定NPC对话后获得碎岩术，这是一种用于破坏岩石障碍的重要技能。在冻瀑洞窟等区域，玩家还能学到攀瀑术等高级技能，这些技能不仅有助于导航，还能在战斗中发挥作用。
完成灯火山的任务后，玩家应返回一之岛的宝可梦中心，将红宝石交给相关NPC，从而获得七岛通行证，解锁更多岛屿间的旅行选项，从而进一步深入二周目的剧情和收集要素。
